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Cómo los científicos deciden qué genomas animales secuenciar

¿Qué tienen en común las ranas, los orangutanes y las cabras con garras africanas? Los genetistas han mirado profundamente, profundamente dentro de sus genes: a estas especies se les ha secuenciado todo su genoma.

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Es posible que haya escuchado sobre la posibilidad de secuenciar su propio genoma completo. Hace unos años, el precio de secuenciar un genoma humano cayó a $ 1, 000. No es un cambio de bolsillo, pero tampoco son los $ 2.7 mil millones que costó secuenciar el primer genoma humano. Con los animales, sin embargo, es más complicado. Como ninguna otra especie de esa especie ha sido secuenciada, es más difícil armar el genoma sin ninguna referencia.

El gusano redondo C. elegans se convirtió en el primer animal en secuenciar su genoma, en 1998. Desde entonces, una mejor tecnología para la secuenciación del genoma ha permitido a los científicos pasar a organismos significativamente más complicados y hacer la secuenciación de manera mucho más rápida y efectiva.

Pero aún es improbable que los científicos alguna vez secuencian el genoma de cada animal. Tienen que escoger y elegir. Entonces, ¿por dónde empezar?

No hay un criterio para tomar esta decisión. A veces es para crear conciencia sobre la especie y su beneficio potencial para la humanidad: esa fue la razón que los investigadores de la Universidad Nacional de Singapur dieron cuando solicitaron fondos para secuenciar el genoma de la víbora del templo a principios de este año, escribe Samantha Boh para el Singapore Times . La víbora es "la única especie de serpiente conocida que produce una toxina llamada waglerin", escribe, "un inhibidor neuromuscular que los científicos creen que podría convertirse en un fármaco relajante muscular".

Más allá de los beneficios médicos potenciales de la secuenciación del genoma, la práctica es importante para la comprensión científica e histórica básica del mundo. "Enclavado en los genomas de las especies vivas están las huellas históricas de los eventos adaptativos que los llevaron a donde están hoy", dijo Stephen O'Brien, jefe del Laboratorio de Diversidad Genómica, en una conferencia.

Estudiar los genomas actuales de los animales puede contarles a los científicos sobre su pasado como especie y la historia de los entornos donde han vivido y las otras especies que han vivido con ellos. Por ejemplo, los genomas de los animales domésticos pueden ayudar a explicar el pasado de la humanidad. Tanto los humanos como los animales, como las vacas y los cerdos, cambiaron (y continúan cambiando) cuando parte de la humanidad se estableció y comenzó a cultivar. Estudiar cómo evolucionaron a medida que se domesticaron ayuda a los genetistas a comprender los factores en la evolución humana antigua, y puede ayudar a explicar cuándo exactamente se domesticaron los animales.

Los genomas de estos animales domésticos también tienen mucho que ofrecer a la humanidad. "Los genomas de referencia precisos son importantes para comprender la biología de un organismo, para aprender sobre las causas genéticas de la salud y la enfermedad y, en los animales, para tomar decisiones de reproducción", según un comunicado de prensa del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano.

A veces, secuenciar el genoma de un animal ayuda a los científicos a mantenerse alerta. Los investigadores canadienses que normalmente trabajan en el genoma humano secuenciaron el genoma del castor a principios de este año para celebrar el 150 cumpleaños de Canadá. "La mayoría de nuestros esfuerzos están en genomas humanos", me dijo el científico Stephen Scherer. "Pero en realidad nos estimula intelectualmente a mirar más allá de lo que estamos haciendo". No duele que el castor sea el símbolo nacional de Canadá. Porque a veces, las buenas relaciones públicas son una razón tan buena como cualquier otra.

papadum_goat.jpg Papadum, la cabra de San Clemente cuyo genoma fue reconstruido utilizando una nueva técnica a principios de este año. (Brian L. Sayre)
Cómo los científicos deciden qué genomas animales secuenciar